Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms