Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3F3CQ6NXT2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H3F3CQ6NXT2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms