Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms