Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms