Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms