Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHYHD1Q5SRE7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms