Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms