Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms