Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms