Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A12Q504Y0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A12Q504Y0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms