Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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