Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms