Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms