Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms