Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
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