Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms