Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCBQ16585 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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