Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SNAPC1Q16533 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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