Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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