Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SF1Q15637 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SF1Q15637 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SF1Q15637 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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