Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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