Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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