Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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