Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
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