Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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