Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GBX1Q14549 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GBX1Q14549 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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GBX1Q14549 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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GBX1Q14549 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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GBX1Q14549 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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GBX1Q14549 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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GBX1Q14549 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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GBX1Q14549 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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GBX1Q14549 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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