Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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