Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
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