Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIGQ13278 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIGQ13278 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIGQ13278 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIGQ13278 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIGQ13278 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIGQ13278 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIGQ13278 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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