Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DNAJC3Q13217 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNAJC3Q13217 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms