Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
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