Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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TRAF2Q12933 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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TRAF2Q12933 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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TRAF2Q12933 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF2Q12933 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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