Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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PTPN13Q12923 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms