Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms