Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms