Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms