Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms