Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCNT1Q02742 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms