Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms