Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms