Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNAQ00169 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms