Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFM1P61960 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFM1P61960 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms