Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms