Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms