Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME5P56597 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME5P56597 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME5P56597 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME5P56597 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME5P56597 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME5P56597 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms