Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms