Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AQP4P55087 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AQP4P55087 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AQP4P55087 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AQP4P55087 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms