Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms