Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP98P52948 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP98P52948 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP98P52948 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP98P52948 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP98P52948 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP98P52948 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP98P52948 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP98P52948 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP98P52948 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP98P52948 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP98P52948 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP98P52948 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP98P52948 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP98P52948 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP98P52948 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP98P52948 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP98P52948 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms