Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LUMP51884 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LUMP51884 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LUMP51884 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LUMP51884 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LUMP51884 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LUMP51884 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LUMP51884 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LUMP51884 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LUMP51884 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LUMP51884 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LUMP51884 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LUMP51884 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LUMP51884 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LUMP51884 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms